MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong2

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020276	GCG	2	6	53	58	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020276	GCT	2	6	209	214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020276	TAT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020276	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020276	TGC	2	6	303	308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020276	CACATG	2	12	373	384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020276	CCACAC	2	12	386	397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020276	AC	3	6	406	411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020276	GACT	2	8	850	857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020276	AGTC	2	8	872	879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020276	CG	3	6	3156	3161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020276	GC	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020276	CG	3	6	3368	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020276	CG	3	6	3397	3402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020276	CGC	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020276	CCA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_020276	CTG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020276	TCCC	2	8	8765	8772	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_020276	TCC	2	6	8788	8793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020276	C	6	6	8961	8966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_020276	CCA	2	6	9039	9044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020276	GTC	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020276	TC	3	6	9157	9162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020276	CGA	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020276	ACG	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020276	GTG	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020276	CCA	2	6	10306	10311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020276	GC	3	6	10384	10389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020276	ACC	2	6	10415	10420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020276	CG	3	6	10471	10476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020276	GC	3	6	10478	10483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020276	TTC	2	6	10496	10501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020276	AAAC	2	8	10506	10513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020276	CGG	2	6	10530	10535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020276	CGC	2	6	10549	10554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020276	CGC	2	6	10577	10582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020276	ACG	2	6	10621	10626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020276	GGC	2	6	10627	10632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020276	ACG	2	6	10692	10697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020276	CGG	2	6	10738	10743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020276	CG	3	6	10757	10762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020276	GCC	2	6	10828	10833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020276	CG	3	6	10947	10952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020276	GTT	2	6	10964	10969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020276	AGC	2	6	10975	10980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020276	CCG	2	6	10996	11001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020276	CGGTGC	2	12	11020	11031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020276	CAC	2	6	11083	11088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020276	GGC	2	6	11089	11094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020276	CGG	2	6	11109	11114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020276	GC	3	6	16491	16496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020276	TGT	2	6	16741	16746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020276	GCCGG	2	10	17407	17416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020276	AGT	2	6	17807	17812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020276	GCG	2	6	17813	17818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020276	ATA	2	6	17854	17859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020276	AGC	2	6	17877	17882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020276	CGTAGC	2	12	17888	17899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020276	CGC	2	6	18032	18037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.